春秋時期儒學思想興起，隨後影響了後世上千年，直到今天也有極高的教育意義，作為中國歷史上最偉大的思想家、教育家，孔子自認“述而不作”，然而後世將尊稱為“至聖先師”，留下的著作含義深刻，被世人視作真理。

美國艾默生認為，孔子不僅僅是中國人的驕傲，也是全人類的“先師”，以“仁”和“禮”為中心的治國方針，無論是哪種社會體制都適用，孔子的主張打破了貴族與庶民間的界限，表現出來的人道主義精神是政治思想的精華所在。

孔子的思想得到了後世眾多政治家傳承，西漢董仲舒提倡“罷黜百家，獨尊儒術”，實行思想大一統，只有這樣才能長治久安，自此以後，歷代帝王對孔子學說尊崇有加，對孔氏一族給予特殊照顧，即便孔氏族人獲罪，皇帝也不敢輕易動刑。

滿清作為少數民族入主中原建立統治，一個最嚴峻的問題就是如何安撫漢人，畢竟漢人人口眾多，清朝統治者只能採取安撫措施，漢人長時間接受漢族統治，已經形成了一種歸屬感，“反清復明”運動屢禁不止，為了避免陷入戰亂，統治者注重選拔有聲望的漢人為官，希望藉助他們來鞏固自己的統治，康熙皇帝掌權之後，掀起了學習儒家文化的思潮，不僅自己親自拜訪孔子故居，還對孔子後人表現出極大誠意。

孔子64代孫孔尚任，20歲時考中生員，雖然後來沒有被錄取，但是孔尚任從未放棄做官的夢想，為此孔尚任變賣家中財產，募捐得了一個“例監”，此後著書立說，成為清朝最傑出的戲曲作家，康熙21年，孔尚任受命監造祭祀用品，這是滿清入關以後，第一次舉行尊孔大會，因此皇族成員非常重視，孔尚任為眾多大臣講解儒家經典，被康熙破格提拔為國子監博士。

在此期間孔尚任被康熙尊孔的態度感動，表示會為朝廷效力終生，他認為自己終於找到了明君，此外康熙皇帝也認為孔尚任才華橫溢，一路提拔，後來還讓孔尚任遠赴江南治理水患，治水的四年間，孔尚任鬱郁不得志，逐漸對康熙是的賞識感到了懷疑，不過他需要依附於統治階級，孔尚任的足跡走遍了南明故里，結識了許多具有高度民族氣節的南明遺民，在他們的影響下，孔尚任蒐集素材，創作了千古名劇作《桃花扇》，作品包含對大明的懷念，處處充滿了亡國之痛。

《桃花扇》成書以後，各地反清勢力如火如荼，不過天下已定，想要鬧事也不容易，朝廷輕而易舉的就解決了各方叛亂，隨後許多大臣上書啟奏，認為天下大亂都是《桃花扇》惹的禍，康熙命人嚴格查辦，將書籍蒐集起來集中銷燬，隨後下旨搜捕創作者，康熙震怒，決定誅九族處罰，不過當康熙知道《桃花扇》的“幕後主使”後，急忙又命人回來，當眾說道：“此人不能殺啊！”

孔尚任雖然有“謀反”罪過，但是他的身份卻極為特殊，身為孔氏子弟，株連九族萬萬不可，甚至就連孔尚任也不敢輕易動手，康熙認為幾千年來，孔子在漢人心中的地位越來越高，貿然出手很可能會激起民憤，因為一時氣憤釀成大禍，這個後果康熙無法承受，康熙39年，朝廷下旨罷免孔尚任，具體原因並未說明，不過明眼人都知道孔尚任被免官與《桃花扇》脫離不了干係，不過也有人認為真實原因有待考證。

總之無論是否有關係，至少孔尚任保住了一命，心情悲憤的孔尚任返回老家，做過短暫的幕僚，隨後在曲阜逝世。

孔尚任文學造詣極高，留下了眾多文集，戲曲《桃花扇》廣為流傳，《桃花扇》先後歷時10餘年才完成，以侯方域和名妓李香君的悽美愛情故事為主線，塑造了一個個個性鮮明的人物形象，深刻地反映了南明王朝的興衰歷程，真實還原了當時的社會面貌，巨大的感染力吸引了數不清的觀眾競相傳抄，堪稱清朝歷史上最具教育意義的戲劇。