對於雍正皇帝的死，在《滿清外史》、《清宮遺聞》、《清宮十三朝》等野史中也有記載，不過在這些野史著作中都認為雍正是被呂四娘刺殺而死的。要說明這種說法，還要先從雍正六年的文字獄呂留良案說起。

雍正年間，也就是呂留良去世40多年後。有兩位讀書人曾靜、張熙讀了呂氏之書，受其影響，忽然萌生了反清復明的想法。張熙在沿途道聽途說了一些關於雍正殺父、逼母、篡位的傳聞。並聽說忠良岳飛的後人時任陝甘總督的嶽鍾琪都開始上書譴責雍正皇帝了。這些道聽途說來的東西使得曾靜感覺自己舉旗反叛的事蹟已經來臨。於是便同張熙一塊寫了一封策反信，前去策反嶽鍾琪。嶽鍾琪看過之後，見信中全是一些大逆不道之詞，驚訝萬分。慌忙如實上奏雍正帝。雍正皇帝十分震驚，於是便傳諭浙江總督李衛捉拿了呂留良的親族、門生，並銷燬他的所有書籍著作。

傳說呂留良一族慘遭族誅之後，呂的女兒四娘被呂家的一個貼身童僕救出，逃到了深山老林之中。從此隱姓埋名，尋機為父祖報仇雪恨。後來，呂四娘遇到了武藝高超的獨臂神尼。在她的精心指導之下，呂四娘成為一名武藝高超的劍客。一劍砍了雍正的腦袋。這只是野史小說中的一種傳言，也有學者對這些傳言提出過批駁。認為這種行刺之說純屬謠言。因為呂案發生後，他的家人都處於嚴密的控制之下，根本不可能有人漏網。此外，圓明園在皇帝在的時候，防守極為森嚴。呂四娘根本不可能穿過晝夜的巡邏的衛兵，輕易地就進入寢宮，刺殺皇帝。

還有一說認為，雍正皇帝是服丹藥中毒而死。雍正皇帝死後僅隔了一天，也就是八月二十五日，乾隆皇帝就突然下了一道諭旨，驅逐圓明園中煉丹的道士們出宮。新君剛剛繼位，雍正大喪未完，朝中有眾多事務需要處理。乾隆別的事情不去做，而急著下令驅逐數名道士，這種做法確有奇怪之處。

雍正帝在位時間不長，但卻在繼位和死因問題上為後人留下了兩大疑案。也許這些疑案根本就沒有什麼神奇之處。只是後人的種種傳言才給他披上上了層層的神秘面紗，變得撲朔迷離。

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