身為太皇太后的馮氏十分重視研究統治民眾的思想鋪墊。由於漢人十分尊重儒學，太后馮氏就在長安為孔子立廟祭祀。在日常生活中，馮太后自己生性儉素，不好奢華裝飾，御膳簡單，得到了大家的認可。

馮太后在稱制期間，主持了經濟、思想、文化等方面的一系列改革，加速了鮮卑貴族的封建化過程，穩定和鞏固了北魏政權的統洽，使北魏的經濟得到很好的上升。馮太后從奴婢起身，沒有接受過專門的文化教育，更沒有參與管理國家大政的經驗。可是，馮太后聰明果決，猜忌而長於權術，以重管、重罰駕馭群臣，為其所用。

同時，性別的差異給了馮太后很好的駕馭空間，讓她能夠成為一個憑藉自己的愛心和誠懇來統治朝綱的女人，而且管理得十分到位馮太后首先整頓吏治。公元472年，她規定地方牧守按照每年的政績來決定升遷或者懲處。早期的北魏，依舊保持著遊牧民族的習慣，百官沒有俸祿，靠著對外不斷征戰而獲得賞賜。484年，馮太后整治官員薪資，百官俸祿統一由國家籌集發給，不許官吏自籌。

馮太后手腕強硬，堅決懲處貪官汙吏，貪贓滿一匹絹布的一律處死。公元477年，馮太后力排眾議，採納給事中李安世建議，開始主持制定長制、大力改革田畝制、租調製，仿古制立黨、裡、鄰三長，用以代替宗主督護的統治，定民戶籍，按戶徵發調役，改變過去混亂的租調局面。公元485年，均田令的提出很大程度上抑制了豪族的發展，保護了絕大多數農民的利益。公元494年，北魏從平城遷都至洛陽，開始大力推行漢化，變革落後的鮮卑舊制，規定漢語為官方語言，朝廷之上禁鮮卑語，提倡鮮卑貴族與漢族通婚。

在朝廷之中，馮太后也大刀闊斧地進行改革。公元477年，馮太后除掉了死對頭李訴；公元478年，馮太后抑制了孝文帝拓拔宏的母親李氏家族的勢力發展，禁止外戚擅權；次年，馮太后的兩個親戚違反法令，馮太后下令將他們捉拿歸案，禁錮終身。馮太后非常重視對皇室宗室子弟的教育，以詔令的形式下令建立學館，組織他們刻苦學習、掌握本領。馮太后自己作勸誡歌三百多篇目的在於引導年輕人如何修養德操

孝文帝也十分尊敬馮太后，朝中大事完全聽從馮太后的意見。“自太后臨朝專政，孝文帝雅性孝謹，不欲參決，事無鉅細，一稟於太后。”拓跋宏孝文帝18歲時，正式接過了馮太后的權力。奇怪的是，當年急於退位的獻文帝拓跋弘，不知什麼原因又迷戀起了皇權，私下串通守邊的將軍準備殺進京都，趕走馮太后，自己重新執掌。公元476年初夏，因為兵變陰謀敗露，退居二線的獻文帝無顏見江東父老，被迫服毒自殺。與馮太后的較量，以獻文帝的死亡而告終。

馮太后執掌的20多年時間裡，一系列改革政策使比魏社會統治煥然一新，推動了社會歷史發展程序，為之後孝文帝穩定執掌打下了堅實的基礎。公元490年，49歲的馮太后病故，諡號文明太后，葬於大同城北五十里之方山，又名永固陵。文明太后掌握北魏的朝政於自己的權勢之下，敢於衝破封建陋習和男權的束縛，銳意改革，一生始終能為國家著想，為百姓做事，史稱中國古代第一位傑出的女政治家。

“雲中北顧是方山，永團名陵閉玉顏。豔骨已消黃壤下，荒墳猶在翠微間。春深巖畔花爭放，秋盡祠前草自斑。欲吊香魂何處問？古碑零落水潺瑗。”當時的史書沒有記載，當年，美麗的皇后馮氏飛身撲進熊熊火焰的一那，“左右救之”的人是誰？後世的史書也沒有記載，一千多年後的慈禧太后為什麼沒有認真學學馮太后的治國方略。