公務員職務與職級並行規定實施後，原來的非領導職務全部改由職級替代，比如原來是主任科員，套改職級後變為二級主任科員，這兩個概念最大的區別是原來的非領導職務儘管不是實職，但除了不享受實職崗位津貼和相應職權外，其他各方面單位實際上還是按領導來對待，給予必要的分工和政治待遇，只不過職權相對虛一點，以前的非領導職務也有“虛職”的叫法。而職級公務員更多體現在“員”字上，即除了可以享受相應級別的經濟待遇，其他各方面職級公務員與普通幹部沒什麼區別，既不享受工作待遇，也沒有過去非領導那樣的政治待遇。說白了，職級公務員就是一個享受高級別收入的普通公務員而已。

比如題主說的科長晉升四級調研員後被免去了科長職務，如果仍安排在科室，那麼他就是科室的幹部，自然要接受新任科長的指揮。這在理論上沒有問題。

不過體制內有句話“做人留一線，日後好相見”，聰明的人都會給自己留後路，而不會把事情做絕，因此現實中碰到這種情況新任科長只要不是傻子一般不會管得太多，因為他們都清楚這不好管，很多時候也不能管。原因很簡單：

第一，一個科長晉升四調，不是想升就能升的，背後必然有領導的支援，因此如果新任科長僅僅因為對方晉升四調被免了職務而把他當普通幹部來對待，毫不客氣地說這位科長的政商情商有點堪憂了。

第二，科長晉升四調後雖然被免去了實職，可他的級別畢竟上去了，而按照公務員職務與職級並行規定，四級調研員在有崗位空缺的情況下可以隨時轉崗副處實職，符合任職年限甚至可以直接提拔正處實職。換言之，科長晉升四調後隨時可能成為自己的領導，對於這樣一個潛力股，繼任者巴結討好都來不及，一般不會傻到把自己當領導來對待而隨便給對方安排工作得罪對方，為自己以後晉升挖坑。

第三，科長晉升四調後卸任實職，怎麼說也是老前輩老資格，考慮到對方的資歷，繼任者犯不著為了一點工作的事得罪對方，一來顯得不講人情，二來其實也蘊含著巨大的風險，畢竟對方已經退二線了，與一個二線同志計較無數經驗已經證明往往都是當領導的吃虧，正所謂光腳的不怕穿鞋的說的就是這個道理。