無論是史書還是民間傳說，諸葛亮都是智慧的化身，他正直廉潔，一心為蜀國鞠躬盡瘁死而後已，諸葛亮在民間已經被神話，但是人無完人，任何人都有缺點，諸葛亮也不例外。

實話實說諸葛亮的確很聰明，智商不是一般的高，但從性格上來說，他過於謹慎了，事必躬親，把自己搞的太累，最後把自己給累死了。事必躬親的後果除了自己累，還鍛鍊不出來人才，將領出徵時，諸葛亮安排的很周密，還常常搞錦囊妙計，將領不能自由發揮，能力得不到鍛鍊，這也導致了屬國後期無人才可用。

除此之外，諸葛亮還有一個最大的缺點：專政、任人唯賢，不能做到唯才是用，不選拔比自己才能高的人，不喜歡有主見的人。從他提拔人裡面可以看出來，比如說蔣琬、楊洪等人，這些人的性格比諸葛亮還謹慎，並且唯諸葛亮馬首是瞻，除了拍馬屁還是拍馬屁，整個蜀國上下都聽諸葛亮的，但是有兩個人除外，這兩個人就是關羽和魏延，所以諸葛亮內心非常討厭這兩個人。

魏延能文能武、有勇有謀，是一個帥才，並且非常有主見，深得劉備信任，劉備讓他鎮守漢中這點就能看出來。而諸葛亮卻非常討厭魏延，說他有反骨，日後必反，處處打壓魏延，魏延提出的“子午谷奇謀”也被諸葛亮給否決了。魏延有主見，會經常提出自己的想法，這違背了諸葛亮的用人之道，諸葛亮只喜歡聽話的人，對於那些刺頭，諸葛亮當然要處處打壓了。

劉備死後魏延還是忠心為蜀國辦事，並沒有表現出謀反的心思，諸葛亮號稱神機妙算，他說過魏延日後必反，結果到自己快死的時候也沒見他謀反，所以死前利用魏延的性格設下了計謀。諸葛亮死後楊儀誣陷魏延謀反被誅殺，而諸葛亮也保住了一世英名。

關羽性格驕傲自大，除了劉備誰也不服，當然也不服諸葛亮。諸葛亮出山後，關羽處處瞧不起諸葛亮，這也是因為劉備三顧茅廬才請出他，關羽有氣。但是關羽有瞧不起諸葛亮的資本，他是劉備的結拜兄弟，諸葛亮拿他沒轍，還得處處捧著他，比如說給他按了個美髯公的名號，所以說就算諸葛亮討厭關羽，也不敢動他。

後來關羽大意失荊州，兵敗被殺，諸葛亮也只能惆悵的說：荊州不該失，而沒有說出責怪關羽的話，這源於關羽死了，劉備正在氣頭上，二是既然已經死了就沒必要在計較了。後來劉備執意伐吳為關羽報仇，諸葛亮明知不可為，但勸不住劉備。關羽生前諸葛亮不敢動，死後還是不敢動。