在新世紀福音戰士中，EVA初號機還有二號機體內都可以說是比較特別，因為這兩臺EVA都能夠暴走，當中最主要的原因就是因為這兩部EVA中都擁有著人類的靈魂，而作為最早被製作的零號機裡則並沒有暴走的能力，那零號機的設定與另外兩部EVA到底有何區別。

初號機完整地吸收了碇唯的靈魂，而二號機則是部分吸收今日子的靈魂，由於以上的關係可以說這兩部EVA的駕駛員一開始就已經被確定下來，而作為第一適格者的綾波麗表面上似乎也應該是因為在零號機中有親人的關係才會被選擇上才是合理。

而然綾波麗是被製造出來，所以根本就不存在任何的親屬，而EVA零號機在實際的使用過程中並沒有任何特殊的情況出現，發生失控也就是在實驗室的那麼一次，其他情況並沒有發生過，三部EVA可以說零號機的實力應該是最弱，因為無法暴走幾乎就不可能有一擊逆轉的可能，那零號機體內是否有對應的靈魂存在？

關於這個問題其實在渚薰控制二號機突入最終教條的時候就已經展現出來，當時的二號機靈魂處於封閉狀態，渚薰因此可以輕鬆地從外部進行控制，EVA其實並不一定需要駕駛員才能夠行動，假如有可以充當其靈魂的代替品那就可以操控到EVA。

這一點在劇場版中EVA量產機並沒有任何人駕駛，靠著自動即使的插入權裡渚薰的複製靈魂就可以行動，而當時被凍結的初號機為了保護碇真治也能夠自我行動，可以說駕駛員的存在與否其實和EVA能否行動實際上並沒有必然的關係，駕駛員的存在相當於是一個增幅器使得實力更加強大而已。

EVA二號機實際上是根據第一使徒亞當作為模板製作，而渚薰則是擁有亞當的靈魂，二號機體內擁有明日香媽媽今日子的部分靈魂，正常來說並不能夠在不需要同化進行對其操控，只不過那一段時間的明日香受到使徒的精神攻擊使其受到非常嚴重的精神汙染，同樣的情況也影響到二號機內部的靈魂，使其處於封閉。

渚薰那就可以十分容易對二號機進行操控，畢竟身體和靈魂都是出於同一源頭第一使徒亞當，適應性是不存在任何的問題。

而與之對應零號機並不是和二號機一樣複製自第一使徒亞當，而是複製最終教條當中的莉莉絲，而綾波麗體內本來就是是莉莉絲的靈魂，對於適應性來說可以說是等同於渚薰操控二號機，只不過綾波麗並不是和渚薰一樣，因為她是被製作出來強行注入莉莉絲的靈魂，因而在一開始的時候對自己的存在也是不斷地質疑，由於靈魂被過分分割導致損失了大部分原來的記憶。

而零號機在自爆之後也沒有進行修復，之後的綾波麗幾乎失去了作為駕駛員的作用，零號機的出場到此也就結束了。其實零號機假如存在某人的靈魂必然就會是挑選對應的駕駛員，而不是選擇綾波麗作為專職的駕駛員，因為綾波麗是被製作出來灌注莉莉絲靈魂的容器，莉莉絲作為李林的始祖並不存在相熟的靈魂。

至少從種種跡象來看，零號機是體內是並不存在任何靈魂，假如當時零號機在場的話渚薰同樣可以操控著進入最終教條。

在TV版當中鈴原東治本來是作為三號機的駕駛員進入NERV，而他自己也因為自己妹妹的受傷也遷怒真治，實際上東治妹妹在之後就被NERV將其靈魂植入到三號機當中，卻被告知只有成為駕駛員才有辦法治療妹妹，可以說這對兄妹真的是比較命苦，之後的情況所有人都知道。三號機成為使徒之後甚至被DUMMy插頭控制的初號機完全解體，連駕駛艙都給直接捏碎。

相對比來說，零號機應該算是最為特別的一臺，沒有任何靈魂的裝置也沒有任何特殊裝備，只是一臺最為普通的EVA，但這是基於綾波麗身份的特殊性而設計。