在現在的教科書中，有巢氏被列入神話傳說之列，也就是說被認為是可能並不存在的虛擬人物，然而真相是這樣嗎？

根據《韓非子》記載：“上古之世，人民少而禽獸眾，人民不勝禽獸蟲蛇。有聖人作，構木為巢，以避群害，而民說之，使王天下，號之曰‘有巢氏’”。從韓非子的記述可以得知，至少到了戰國時期，人們對於有巢氏的存在還是非常篤定，並沒有將其列為神話傳說。

有巢氏不但真實存在，而且還傳承了非常久的時間。《通志三皇記》和《遁甲開山圖》等古籍記載：“有巢氏王天下百餘代”；《佛祖歷代通載》記載：“有巢氏，百代，不記年”。可見，有巢氏世代有上千年、甚至數千年之久。《逸周書史記解》則記載：“昔者有巢氏，有亂臣而貴任之，以國假之，以權擅國而主斷，君已而奪之。臣怒而生變，有巢氏王”，詳細記載了有巢氏世代滅亡的原因。當然，有巢氏還在許多其他歷史古籍中有記載，如《史記》、《莊子》等。

有巢氏之後是燧人氏，燧人氏之後是伏羲氏。伏羲氏去世後女媧氏承襲伏羲氏之號王天下，女媧氏之後繼續有十五代帝王繼承伏羲氏之號王天下，其中第十三代帝王為有巢氏之後。帝堯之時，有巢氏後裔巢父為當世高士，堯帝以天下相讓，巢父不受，隱居聊城，放牧為生。大禹治水，有巢氏後裔配合大禹治理江淮水患，並將女兒偃攸嫁給大禹生子啟（後建立夏朝）。大禹封有巢氏後裔建立巢國，巢國曆經夏商周三代，延續一千六百多年，公元前518年被吳國所滅。由此可見，有巢氏不但歷史悠久，而且傳承和影響都非常久遠。

有巢氏統治的核心區域在今日江淮地區，其中心在巢湖一帶。今日巢湖等帶“巢”之古地名，均來源於“有巢氏”。巢國為吳國所滅後，巢國後代便以國為姓，是今日巢姓的祖先。有巢氏的歷史存在不容忽略，更不容否定，國家對此已有定論，《經濟要參》：“有巢氏時代代表著人類從原始穴居向巢居文明過度的新階段，是人類和動物逐漸分離的文明啟蒙時代，所以把有巢氏定位為‘文明的領航者’當之無愧”。