公元396年，拓跋珪集合大軍，直撲燕國。

首先遭到攻擊的是慕容農鎮守的幷州（今天的山西一帶）。

慕容農見魏軍人多勢眾，不敢迎戰，連夜帶著老婆兒子向東逃走，魏軍輕鬆地拿下幷州。

由於後燕在參合陂之戰中慘敗，元氣大傷，慕容寶無力穩住大局，所以各地守軍無心抵抗，紛紛逃跑或者投降，在魏軍強大的攻勢面前，後燕很快只剩下三座城池：都城中山（今天的河北定州一帶）、鄴（河南安陽一帶）以及信都（河北省衡水市冀州區一帶）。

根據以往和慕容寶交手的經驗，拓跋珪估計慕容寶不會發起進攻，只會在都城中山堅守，中山城池堅固，一時難以攻下，因此拓跋珪命令魏軍離開中山，先進攻鄴和信都。

慕容寶的確不擅長進攻，不過他現在已經被逼到了絕境，於是決定要搏一把。

慕容寶一改常態，主動出擊，親自帶兵進攻魏軍控制下的楊城。拓跋珪聽說之後，立即帶兵來支援楊城。

不到最後一刻，誰都不敢說自己一定是贏家。死地求生的慕容寶，在楊城差一點就幹掉了拓跋珪。

當天晚上，慕容寶率軍全體出動，在夜幕的掩護下，偷偷接近了魏軍軍營，然後衝入砍殺，四處放火。

當時拓跋珪還在睡覺，大火已經燒到了他的營帳，拓跋珪被喊殺聲驚醒，只見燕軍到處放火，己方士兵驚慌失措。

對緊急事件的處理，往往能體現出一個人的能力高低。

危急時刻，拓跋珪沒有亂，他第一時間跑出去擊鼓，用鼓聲把將領們召集在一起，首先恢復了指揮系統。

然後拓跋珪讓將領們集合各自隊伍，把騎兵集中起來，擺好攻擊陣型，對燕軍發起衝擊。

燕軍當時放火放得正歡，還沒想到魏軍這麼快就反應過來，大敗於魏軍，被殺了一萬多人。

這是慕容寶最有可能幹掉拓跋珪的一次機會，然而由於拓跋珪理性的應對，慕容寶還是失敗了，被迫退守中山。

中山是後燕的都城，有著完善的防禦設施，本來燕軍可以在這裡堅守很長時間，可惜的是，他們這次又內訌了。

這次內訌的主角和之前一樣，還是慕容寶和慕容麟。

慕容麟是慕容寶的親兄弟，他野心不小，對慕容寶這個君主，他一直不服，想找機會取而代之，有他這樣的挑事者在，燕軍很難做到團結一心。

面對魏軍的進逼，慕容麟的手下不是想著如何退敵，而是暗中策劃如何幹掉慕容寶，結果訊息走漏，被慕容寶反殺。

這件事讓慕容麟和慕容寶徹底決裂，慕容麟怕慕容寶對付自己，先下手為強，派人劫持了禁軍首領慕容精，逼他帶領禁軍進攻慕容寶。

然而不是所有人都可以用武力逼迫的。慕容精不想自相殘殺，拒絕了慕容麟的要求。慕容麟惱羞成怒，殺死慕容精，然後逃走了。

慕容麟這一跑，引發了連鎖效應。

當初慕容寶怕自己的兵力不足，派兒子慕容會帶領幽州部隊過來增援，現在慕容麟跑了，慕容寶怕慕容麟在路上襲擊慕容會的人馬，決定自己帶人去和慕容會匯合。

於是慕容寶讓族人慕容詳留守中山，自己和慕容農、慕容隆帶上少數人馬去路上迎慕容會，雙方最終在薊（北京附近）相遇。

兩軍會師本來是件高興的事，可惜好景不長，慕容家族又一次內訌了。

慕容會是慕容寶的第二個兒子，之前負責在幽州訓練軍隊，辦事盡心盡力，深得幽州部隊的擁護。

但是慕容寶立的太子卻是能力平平的慕容策，這讓慕容會非常不滿。慕容寶看出了慕容會的心思，怕他作亂，準備把他調離幽州部隊。但是幽州部隊是慕容會一手訓練出來的，和慕容會關係很深，將士們聽說要調走他，紛紛來嚮慕容寶請願，請求收回成命。

這反而起了反作用。

慕容寶的左右看到幽州部隊這麼力挺慕容會，更加害怕，勸慕容寶趕緊殺了慕容會，以絕後患。

猜忌是一種惡性互動，它使雙方的隔閡越來越深，可能造成嚴重的衝突。

慕容會聽說慕容寶一方想殺自己，乾脆先發制人，帶兵攻打慕容寶，慕容寶兵少難以抵擋，被迫逃往龍城。

慕容會帶兵追來，在城外提出要求，要求慕容寶誅殺奸臣，立慕容會為太子。

生死關頭，慕容寶還是有骨氣的，拒絕了慕容會的要求，於是慕容會帶兵包圍了龍城。

這時慕容寶身邊一個叫高雲的衛士挺身而出，組織敢死隊夜襲慕容會，竟然擊潰了慕容會的部隊，慕容會逃回中山，被中山的守城官慕容詳殺死。

慕容會本來有可能成為一名殺敵的猛將，然而由於內訌，最終死在了自己人手裡。

殺死慕容會之後，慕容詳也沒能蹦韃多久，因為愛折騰的慕容麟回來了。

慕容麟一直想過一把當老大的癮，現在慕容寶離開了中山城，他覺得機會來了，於是帶領人馬回去幹掉了慕容詳，慕容麟終於當上了中山城內的老大。

後燕的統治者們自己鬥得不亦樂乎，他們似乎忘了魏軍的存在。慕容麟好不容易當上了一城之主，卻發現自己面臨的是個爛攤子，由於魏軍的封鎖，中山城得不到補給，糧食已經快吃完了。

沒辦法，慕容麟只好帶兵離開中山，魏軍藉機對他發起進攻。魏軍出發之際，有個叫晁崇的大臣卻跳出來阻止，而且用的是一個奇葩的理由∶今天打仗不吉利。

拓跋珪被嚇了一跳，難道打仗還得選黃道吉日？

晁崇∶“今天是甲子日，當年商紂王就是在甲子日被打敗的，所以今天打仗不吉利。”

拓跋珪沒好氣地反問一句∶“商紂王在甲子日被打敗，那周武王不也是在甲子日打贏的嗎？”

這下晁崇沒話說了。

在魏軍的大舉進攻下，慕容麟屢戰屢敗，最後單槍匹馬逃到了鄴城（今天的河北省臨漳縣一帶）。

鎮守鄴城的是慕容垂的弟弟慕容德，他知道慕容麟是個禍害，於是下令殺死了慕容麟。

愛折騰的慕容麟，終於不能再折騰了。

慕容麟離開中山之後，中山再也沒有重兵把守，魏軍順勢拿下了中山。

中山是後燕的都城，位於後燕中部，中山一帶的陷落，使得後燕被分為南北兩部分，北部依然聽從慕容寶號令，南部則被慕容德控制，並逐漸演化為南燕政權（就是後來被劉裕滅掉的那個），後燕因此國力大減，再也無力和北魏抗衡。

隨著地盤越來越大，原來的都城盛樂已經顯得過於靠北，不利於統治南邊的廣大土地。公元398年，拓跋珪下令把都城向南遷移到了平城（今天的山西省大同市一帶）。

之後北魏大建宮殿，確定官員制度，加強對各地的管理，為了改善官場的風氣，拓跋珪甚至親自審問那些違法亂紀的官員，北魏的各方面管理越來越成熟。