孫沔和狄青相繼回朝，但餘靖則並未回京領命，餘靖留在邕州做戰後的處理。餘靖主要任務是清理儂智高的餘黨、穩定廣南東西路的民心。其職責完成後，不再回京任職，而是仍知桂州。

儂智高的叛亂已經平定，此時獨留餘靖在廣南西路的桂州是朝廷特意為之，並非是餘靖在此次平亂中無功，相反餘靖在桂州實為替朝廷鎮守廣南兩路。餘靖對此地區的風俗和民情瞭解較深，對恢復戰後廣南兩路的經濟和社會秩序有益。這正是朝廷看中餘靖能力的特別處置，也是餘靖在平定儂智高叛亂中起作用的重要表現之一。

朝廷經過一系列的措施緩和了受戰災地區的矛盾，保證了廣南兩路的基本穩定，狄青出征大敗儂智高叛軍，讓軍情緊急的廣南兩路轉危為安，仁宗甚為大喜。

此次仁宗仍問策於龐籍，是否可升狄青為樞密使。龐籍的回答是不可，同時龐籍向仁宗指出，太祖時期慕容延釗收復荊南、湖南等地的例子，說明只能厚賞於武將大臣，不可將其升為樞密使，掌握實際的軍權，此乃祖宗之法。

另外，龐籍還提到如現在升狄青為樞密使，那日後狄青如再立更大的戰功將如何封賞？而且，如今朝中宰相併不缺位，如若突然升狄青為樞密使，會引來朝堂非議，這樣的做法既有損朝廷利益，又會給狄青招致更多的怨恨。龐籍在勸阻仁宗時，數次提及，朝廷向來是以文臣為宰相，武臣不可擔此重任。這很明顯的是作為文臣宰相對武臣為相的一種不信任。

龐籍的此次勸說沒有改變仁宗的想法，仁宗認為對狄青的賞賜太薄，所以升狄青為樞密使，孫沔為樞密副使，在此次的平定儂智高叛亂中只剩下餘靖未加封賞。

總之，在基本平定了儂智高叛亂之後，朝廷下旨將孫沔和狄青都調回京城。而餘靖雖升官但差遣仍知桂州，繼續替朝廷鎮守兩廣，安撫民心。此次平定叛亂主要負責的三人餘靖、狄青、孫沔，都在平叛中做出了重要的貢獻。餘靖雖沒有像狄青一樣在平叛中鋒芒畢露、取得顯赫軍功，但餘靖在平定儂智高叛亂中、起著不可替代的作用，其主要分為四個方面。

一、餘靖從儂智高叛亂後不久，就接命負責經制廣南東路和廣南西路的盜賊，負責平定叛軍。其中曾與餘靖共同負責此事的楊畋因治賊不利，令儂智高相繼攻下數十州而被罷職，但餘靖仍留命負責廣南兩路的事宜。餘靖對此次平定叛賊，付出了將近一年的時間，相比於狄青和孫沔，餘靖參與了平定儂智高的始末，對當時的軍情和當地的民情都最為了解。

二、朝廷之後派狄青前來幫助平叛時，餘靖給予了狄青很大的幫助，並十分配合狄青在前線的人員安排。餘靖與狄青本有私人的過節，但是在狄青至濱州整頓軍隊風氣時，餘靖作為統帥 先承認自己的不足，為其他的將領和士兵們做了表率。

所以，狄青才能快速有效的調整軍隊計程車氣，進一步做好應戰的準備。這與餘靖不計私人恩怨，積極配合狄青的各項整頓工作有直接的關係。同時，此次餘靖的虛心和公正、讓他與狄青在共事中化解了二人的誤解，二人冰釋前嫌、同仇敵愾，在接下來對儂智高討伐時才取得了大勝。

三、餘靖在此次平定儂智高叛亂時在體察民情、安撫百姓、負責各項民事中做出了自己的貢獻。在軍事調遣上餘靖不作更多的調配，狄青身為主帥負責此事。但餘靖也作為參謀者把握大的時局方向，保證平定儂智高叛亂能順利進行。

四、餘靖還要負責軍隊的後援工作，在前線軍情緊急時要統籌全域性，處理好前線和後方的排程工作。後來在大敗儂智高之後，狄青和孫沔相繼被調回京城，而餘靖則留至桂州，負責處理叛賊餘黨的清理、安撫救濟受戰災地區的百姓。無論是危急時刻還是轉危為安之後的和平時期，餘靖始終為朝廷堅守廣南兩路，對宋代西南邊疆地區的治理做出了巨大的貢獻。

總之，在平定儂智高叛亂中餘靖盡職盡責、奔波勞累，雖未像狄青一樣取得巨大的戰績，但在狄青大勝的背後確有餘靖的辛勞。與其說餘靖負責平定儂智高叛亂，不如說餘靖在平定儂智高叛亂中，是朝廷掌控大局的參謀者、和平叛各項事宜的後援支持者。