奧古斯都將埃及設為羅馬行省後，便馬上開始在埃及推行皇帝崇拜。埃及作為元首的私人行省，與小亞等其他地區相比有著特殊性，因此其皇帝崇拜也有著自身的特點。
首先，由於埃及不存在像小亞地區一樣的城市議會或者類似的組織，所以埃及地方上的精英階層無法採取聯合協調的行動，沒有像小亞一樣自發主動地建立皇帝崇拜。埃及的皇帝崇拜主要是在羅馬皇帝或者他的代理人埃及總督的推動下建立起來的。
其次，埃及是元首的私人行省，羅馬元老院無論在名義上還是實際上都沒有任何控制權，不過元老院在名義上是羅馬國家的代表，所以為了避免埃及受到元老院的任何影響，作為羅馬國家擬人化的羅馬女神並沒有像在小亞一樣同奧古斯都一同接受崇拜。作為由國家推行的皇帝崇拜，必然會建立起較為完善的祭司體系，並且建設為皇帝及其家族獻祭的皇帝神廟。
一、亞歷山大里亞和全埃及的祭司長
‘’亞歷山大里亞和全埃及的祭司長‘’是由羅馬皇帝直接任命的，由羅馬人擔任，一般屬於騎士階層，對埃及的所有宗教崇拜活動都有監督管理職責，包括皇帝崇拜。關於‘’亞歷山大里亞和全埃及的祭司長‘’這一職位設定的時間，學術界有不同的觀點。
有的學者認為，這一職位的設定始於哈德良統治時期，但是很多學者持不同意見。卡波尼認為這一高階職位在奧古斯都統治時期就己經被引入埃及。利格斯比也認為‘’亞歷山大里亞和全埃及的祭司長‘’很早便己存在，很可能早於公元40年，是提比略為其前任所設立，而到卡里古拉統治時期，‘’亞歷山大里亞和全埃及的祭司長‘’的職責擴充套件到對現世統治者的崇拜。
‘’亞歷山大里亞和全埃及的祭司長‘’負責審批人們擔任祭司的申請。埃及宗教受奧西里斯崇拜的影響，其所有祭司都需要施行割禮，希臘羅馬人到來之後也繼承了這種傳統。根據紙草文獻的記載，申請成為祭司的人需要得到‘’亞歷山大里亞和全埃及的祭司長‘’的允許才能舉行割禮，所以管理埃及祭司的准入是‘’亞歷山大里亞和全埃及的祭司長‘’的重要職責之一。
‘’亞歷山大里亞和全埃及的祭司長‘’還負責協調人們同埃及神廟的關係，負責調解相關的糾紛。在與神廟有關的繼承權糾紛案件中，‘’亞歷山大里亞和全埃及的祭司長‘’甚至擁有司法管轄權。
從上分析我們可以看出，‘’亞歷山大里亞和全埃及的祭司長‘’的職責似乎更多地是宗教事務的行政管理方面，更像是政府官員而非神職人員。人們至今也沒有發現明確的關於‘’亞歷山大里亞和全埃及的祭司長‘’作為祭司主持皇帝祭祀儀式等的文獻記載。
所以也有人認為，由於‘’亞歷山大里亞和全埃及的祭司長‘’對埃及的所有宗教崇拜實行管理監督，雖然他有‘’祭司長‘’的頭銜，但是卻沒有帝國祭司的功能，實際上是一種政府官員‘’。
但是，僅根據紙草文獻中沒有相關的記載就推斷祭司長不具備任何祭司功能是不對的，而且祭司長送一宗教頭銜也表明他具有宗教職能。帝國極權統治下其他地區擁有類似頭銜的祭司長都有負責皇帝崇拜的祭司職責，埃及的祭司長應該也是如此。
至於‘’亞歷山大里亞和全埃及的祭司長‘’具有行政管理的許可權，筆者認為，這與其祭司職能並不衝突。根據本論文第一章的分析，埃及的官僚體系，尤其是其中的高階官吏，其行政和司法許可權經常混淆不清，職責範圍很廣，同樣，作為皇帝直接委派的最高祭司，其擁有行政和司法許可權是很正常的事情。另外，‘’亞歷山大里亞和全埃及的祭司長‘’的頭銜沒有固定的格式，它還常被稱為‘’奧古斯都神和偉大的塞拉匹斯的祭司長，管理全埃及的神廟的人化‘’。這一頭銜表明他既負責奧古斯都崇拜，也負責塞拉匹斯神崇拜，同時對埃及的宗教事務負有行政管理職責。
我們可以根據這些頭銜推測，和在整個埃及推行的奧古斯都崇拜一樣，羅馬統治時期對塞拉匹斯神的崇拜也佔據了相當重要的地位。
二、‘’城市的祭司長‘’
‘’亞歷山大里亞和全埃及的祭司長‘’負責全面管理埃及的皇帝崇拜等宗教事務，而在各諾姆首府，皇帝崇拜分別由一名‘’城市的祭司長”負責。‘’城市的祭司長‘’一般只能由富有家族的成員擔化因為擔任此類官職的濟負擔很重，需要承擔很大一部分公共宗教慶典的責任。‘’城市祭司長‘’既負責皇帝崇拜，也負責其他神的崇拜，這也許是它被稱為‘’城市的祭司長‘’的原因。
它很可能是從當地的傳統祭司中選任的，因為城市中所有其他神都是由當地的祭司按照當地的傳統進行崇拜，而皇帝崇拜不是從埃及或者希臘社會成長起來的崇拜形式，一開始並沒有地方上的祭司，因此其職責需要由當地祭司承擔。
紙草文獻中關於‘’城市的祭司長‘’的記載從公元2世紀開始才多了起來，這似乎說明這一官職從2世紀才開始出現，但是各方面的證據都表明埃及的皇帝崇拜從奧古斯都統治時期便己存在，這就出現了衝突。
有一篇亞歷山大里亞人的銘文可能能夠解決這一矛盾問題。這篇銘文是一位名為阿波羅的祭司所作，他是馬可奧裡略（在位時間公元161年一180年）時代的‘’城市的祭司長‘’。阿波羅列舉出了他的家譜，從其中我們可以知道幾乎他所有的祖先和親屬都曾擔任這一祭司職位，這一職位應該是從公元1世紀便掌握在他的家族手中。