沙田柚的花為總狀花序，花序帶葉或不帶葉，以無葉花序居多。每條結果母枝通常有1-7個花序，1個花序通常有3-15朵花。沙田柚花蕾大，花大，花屬完全花，白色，一朵正常的花由花梗、花萼、花瓣、雄蕊及雌蕊5個部分構成。除正常花外，由於花芽分化過程中溫度劇變、樹體營養失調及蕾期花蕾蛆危害等原因，還會出現花器官退化現象，形成多種畸形花，如燈籠花、露柱花或退化花，這些花都已失去受精能力，花不開或開後即全部脫落。多花的花序，一般其基部的花較弱，花朵較小，發育不良，而花序頂端的花又多數是畸形花，只有花序中部的花朵發育正常而且健壯，花朵較大，坐果率高。在人工授粉疏除過多的花序、花蕾時，應注意這個特點。

一般沙田柚主要有5種花序：有葉花序、無葉花序、有葉單花、無葉單花和腋生花。有葉花序是指花序枝的基部有1-3片葉；無葉花序則指花序枝上沒有葉片；有葉單花是指花序枝上只有1朵花，並且有葉片；無葉單花是指花序上只有1朵花，沒有葉片；腋生花是指花序枝上每一片葉的葉腋處均著生有1朵花。

據調查，沙田柚有葉單花和無葉單花的坐果率最高，有葉花序和無葉花序的坐果率很低。但由於有葉花序和無葉花序在所有花序中所佔的比例很大，因此它們仍然是沙田柚主要的結果花序。一般壯旺樹有葉花序較多，弱樹則很少抽生有葉花序。

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