金陵十二釵中，秦可卿已經是“謎”一般的存在，可是，若論神秘度，秦可卿還得輸妙玉幾分。
寄居在榮國府大關於櫳翠庵的妙玉，是一個帶髮修行的尼姑。然而自妙玉出場，便是雲籠霧罩一般。我們只知道她蘇州人氏，官宦世家出身。其隨師父從蘇州進京，對外宣稱是觀瞻“觀音遺蹟”及“貝葉真經”而來。但後來據邢岫煙所云，是其不被權勢所容才離開了蟠香寺。
妙玉再次出場時，是在賈母攜劉姥姥逛大觀園時，眾人在櫳翠庵品茶。期間妙玉邀黛玉和寶釵進禪房喝梯己茶，寶玉尾隨而至。這妙玉在為黛玉和寶釵端茶時，用的分別是點犀喬和頒瓟斝兩件名貴珍品，而將自己素日用的綠玉斗給寶玉斟茶。在賈寶玉開玩笑“質疑”其將名貴茶杯給兩位姑娘，自己卻用”俗器“，稱其厚此薄彼時，妙玉冷笑道：“不是我說狂話，只怕你們家未必能找出這麼一件俗器來”。口氣之大令人心生疑竇，這女尼，絕非一般官宦人家的女兒，其家世根基絕對在賈府之上。
妙玉再一次出現時，是第七十六回中秋之夜，黛玉和湘雲荷塘聯句，妙玉突然閃出，幾位金釵討論了一夜詩文。而這一次，前八十回妙玉最後一次出現。
雖然出場次數極少，但是妙玉這位憑其出色的姿容、滿腹的才情、怪異的脾性、超高的生活品味和神秘的身世，成功吸引了讀者們的注意力。
眾所周知，賈家最終將笙歌歸院落，燈火下樓臺。屆時這位孤傲的女尼，將何去何從？歷來人們猜測紛紛，莫衷一是。
在現今的通行本中，妙玉在後面四十回又上了兩次回目，一次是“坐禪寂走火入邪魔”，最後是“活冤孽妙尼遭大劫”。大意是妙玉對賈寶玉動了春心，在和惜春下棋時，借棋局和賈寶玉調情，回去後魂不守舍以致走火入魔，這訊息傳出府外，外頭的浪子都聽聞了榮府內有一個風流尼姑。後來賈府被抄後，一群賊人趁火打劫，有人用藥物迷暈了妙玉，將其抱走。這麼一個清潔的女兒，就此遭到了荼毒。
可是，這種結局真的符合原作者的本意嗎？
凡略諳《紅樓夢》者，便明白這種寫法完全違背了原作者的情理邏輯。主要因為續書中的妙玉被嚴重庸俗化，原本一個超凡脫俗、剋制自愛的女尼變成了沉淪情和欲的女子，試圖藉此為妙玉“遭陷泥淖”作鋪墊。而後文描寫妙玉和惜春交情甚好，可是在前八十回中，妙玉這位清高孤傲的女子，看上的只有黛玉、寶釵這樣的人尖子。再說惜春本性孤介，對自己的姐妹們都涼薄對待，又怎麼會和妙玉扯到一處？所以續書中的妙玉，是一個庸俗小說寫手筆下的妙玉，結局就更脫離原著本意了。如果看過《二刻拍案驚奇》的朋友還會看出，這是根據其中“襄敏公元宵失子，十三郎五歲朝天”一回所描寫的真珠姬被強盜劫掠姦汙一段情節的拙劣複製。
那麼，根據前八十回的線索，妙玉的結局該是怎樣的？就第五回的判詞和紅樓夢曲《世難容》來看，妙玉的結局，必然是悲劇收場的，而且是“終陷泥淖中”，這麼一個孤傲清潔的人兒，最後卻不得不接受最骯髒的事情。而在此之前，妙玉都經歷了些什麼？
可以確定，妙玉的悲劇一定與賈寶玉有直接關係
如果我們留心，便發現薄命司中的金陵十二釵，除了妙玉，皆與賈寶玉有著緊密的聯絡。寶釵、黛玉和湘雲，都與賈寶玉為表親關係，併產生了情感糾葛；賈府四春，是賈寶玉的姐妹；李紈和王熙鳳，是賈寶玉的嫂子；秦可卿是賈寶玉侄兒媳婦，最主要是引領賈寶玉進入太虛幻境，並與其成親之人；巧姐是賈寶玉的侄女。獨獨妙玉，在前八十回簡直是孤立的個體，卻能位列第六名，越過迎春、惜春、王熙鳳等人，緊隨史湘雲後面。妙玉憑什麼？
只要我們細細分析，便發現能位列金陵十二釵者，要麼是“四大家族”中人，要麼和賈寶玉產生了情感糾葛。所以不是“四大家族”之人的妙玉，只能和賈寶玉發生了非常密切的關係，才能在薄命司正冊中佔重要位置。
妙玉對賈寶玉的情感
妙玉的師父，是“精演先天神數”的，在其臨終之際，囑託妙玉絕對不能回鄉，並告訴她：“在此淨居，自然有你的結果”。一般來說，出家人講的是“求成正果”，可是這師父卻稱“結果”，顯然，這種結果是指妙玉的俗緣。而這俗緣，正是未來和賈寶玉發生的種種糾葛。
雖然極力剋制，但是妙玉對賈寶玉的愛慕，眾所周知。最明顯的是“品茶櫳翠庵”一節，妙玉對劉姥姥用過的名貴杯子棄之如敝屣，卻將自己日常用來喝茶的杯子給賈寶玉斟茶。根據佛門戒律，為免葷素不分，即使是凡俗女子，妙玉也不能與其共用日常生活用品。可是妙玉不僅讓凡俗人士用了自己日常茶具，對方還是個男子。此舉在今天看來，男女共用一個被子，都已極盡曖昧旖旎了。
由此可見，妙玉對賈寶玉感情至深，甚至到了激動處不避嫌疑的程度。
更有賈寶玉生日，夜宴次日才發現妙玉送來的一張壽帖。足以暴露妙玉的內心秘密。因為與賈寶玉同一天壽辰的還有平兒、寶琴和邢岫煙。而邢岫煙與妙玉鄰居十年，還有師徒情分，可是對於邢岫煙，妙玉毫無表示，獨獨記住了賈寶玉。
所以，在聽到賈寶玉稱妙玉給自己壽帖時，邢岫煙洞悉了妙玉的內心秘密，上下打量賈寶玉半日才笑道：
“怪道俗語說的‘聞名不如見面’，又怪不得妙玉竟下這帖子給你，又怪不得上年竟給你那些梅花……”
邢岫煙看出來了，妙玉這位終日與青燈古廟相伴的女尼，對寶二爺情有獨鍾。
可是，我們都知道賈寶玉一生只鍾情林黛玉，而妙玉受制於清規戒律，不可能破戒與賈寶玉有實質性的情感接觸，那麼他倆如何產生密切的聯絡呢？
只有一個可能，那就是將來賈家敗落，妙玉對賈寶玉的情感使她甘願捨棄自己，救了賈寶玉。
在邢岫煙和賈寶玉的談話中，邢岫煙用一句話形容了妙玉，就是“僧不僧，俗不俗，男不男，女不女。”此句話出自《西廂記》。
《西廂記》中，普救寺有一個燒火和尚叫惠明，素日只會“吃酒撕打”，不愛念經禮佛。然而在孫飛虎兵圍普救寺，要強搶崔鶯鶯為妻時，張生出謀劃策，萬事俱備，只欠一個信使。放眼望去，無人敢攬這個送命活。只有惠明和尚挺身而出，棄個人安危於不顧。
惠明在破圍送信前，其唱道：
我經文也不會談，逃禪也懶去參，戒刀頭近新來鋼蘸，鐵棒上無半星兒土漬塵緘。別的都僧不僧、俗不俗，女不女、男不男……
略諳《紅樓夢》者皆知，《西廂記》相關資訊在書中隨處可見。而作者為何偏偏將形容惠明和尚的話用在了妙玉身上？除了暗示這兩位出家人生性放誕詭癖，不按常理出牌，更有一層意思，那就是兩人都義薄雲天之人。
而從前八十回給出的線索，我們可以確定，將來賈家被抄，除了賈家自己作妖，主要是“雙懸日月照乾坤”，是忠順王和北靜王鬥爭的結果。跟蔣玉菡失蹤忠順王先為難賈府一樣，屆時賈府是先出頭的椽子。而作為當日得罪忠順王的賈寶玉，必然被忠順王所報復。
更可怕的是，抄家時藏在櫳翠庵的妙玉被逼現身，這些身世神秘的女子也會引發忠順王的興趣，顯然，妙玉的身世並不簡單，甚至是罪臣之女。那麼如何應對這些棘手的問題？
幸好，從忠順王流連優伶來看，這個王爺除了對權力迷戀，還極迷幻聲色。面對妙玉這等絕世佳人，當垂涎三尺，而為了避免身世被深挖導致賈家罪上加罪，更為了施救寶玉，妙玉選擇了委身忠順王。
當日最高傲孤潔，目下無塵的絕世佳人，不得不屈從枯骨，好似一塊美玉落入了泥淖之中。真叫一個焚琴鬻鶴，哀梨蒸食！
正因此，雖然身在“四大家族”之外，雖然僅僅是單戀賈寶玉，但是妙玉對賈寶玉有救命之恩，這分量，足以讓她位列金陵十二釵中的重要位置了。