1991年，海南的經濟正遭受低潮。由於磚廠停產，潘石屹不得不重回海口。他結識了馮侖、王功權、劉軍、王啟富、易小迪等，他們共同創立了海南萬通，6個人性格鮮明，各有所長，共聚一堂，呼嘯聚義，被稱為萬通六君子。王功權擔任法人代表和總經理、馮侖為副董事長、王啟富、易小迪、劉軍為副總經理、潘石屹最初是總經理助理兼財務部經理，後成為副總。

1992年，海南房地產崩盤，萬通決定讓加入不久的潘石屹，到北京打先鋒。潘石屹蓋起了著名的標誌性建築—北京萬通新世界廣場。整個萬通全靠潘石屹在北京賺錢。1995年，潘石屹分家出走，搞了SOHO現代城，萬通六君子開始分裂。

潘石屹是最後一個加入萬通六君子，以萬通的鼎力支援上位，1995年就退夥，因為在萬通融資過程中結識女投行家張欣，並在1994年結婚。1995年在張欣的支援下，潘石屹單飛成立了SOHO中國，張欣任“聯席總裁”，夫妻店模式確立，潘石屹進入開掛人生。

在六人的共同努力下，萬通事業發展蒸蒸日上，但一山難容二虎，何況是他們個個飽含激情，才華橫溢。在潘石屹走後，1995年3月，王啟富和易小迪選擇離開；1998年，劉軍轉身；2003年，王功權也最終出走，萬通只剩下馮侖獨掌船舵。

潘石屹名利雙收，在許多中國人眼裡，他只是個來自西部地區的年輕人，卻最終靠自己的才能和進取精神，最終躋身行業先鋒，潘石屹，也成為了一代人心中的英雄。名利雙收的他，一度被人稱為儒商。

2014年，潘石屹夫婦與哈佛大學簽訂了金額為1500萬美元協議，與耶魯大學簽訂了捐助協議，累計資助6個億，潘石屹說是為資助在世界一流大學攻讀本科的中國貧困學生，這一說法，立即遭到了很多人的質疑。